Linux下的木马通常是恶意者通过Web的上传目录的方式来上传木马到Linux服务器，为做防护，我们可根据从恶意者访问网站开始-->Linux系统-->HTTP服务-->中间件服务-->程序代码-->DB-->存储，逐一设卡防护。
1.开发程序代码对上传文件类型做限制，例如不能上传.php程序。
2.对上传的内容进行检测，检测方式可通过程序、Web服务层、数据库等层面控制。
3.控制上传目录的权限以及非站点目录的权限。
4.传上木马文件后的访问和执行控制。
5.对重要配置文件、命令和WEB配置等文件做md5指纹及备份。
6.安装杀毒软件，定期监测查杀木马。
7.配置服务器防火墙及入侵检测服务。
8.监控服务器文件变更、进程变化、端口变化、重要安全日志并及时报警。
2. linux服务器中木马怎么处理
以下从几个方面在说明Linux系统环境安排配置防范和木马后门查杀的方法：
一、Web Server（以Nginx为例）
1、为防止跨站感染，将虚拟主机目录隔离（可以直接利用fpm建立多个程序池达到隔离效果）
2、上传目录、include类的库文件目录要禁止代码执行（Nginx正则过滤）
3、path_info漏洞修正：
在nginx配置文件中增加：
if ($request_filename ~* (.*)\.php) {
set $php_url $1;
}
if (!-e $php_url.php) {
return 404;
}
4、重新编译Web Server，隐藏Server信息
5、打开相关级别的日志，追踪可疑请求，请求者IP等相关信息。
二.改变目录和文件属性，禁止写入
find -type f -name \*.php -exec chmod 444 {} \;
find -type d -exec chmod 555 {} \;
注：当然要排除上传目录、缓存目录等；
同时最好禁止chmod函数，攻击者可通过chmod来修改文件只读属性再修改文件！
三.PHP配置
修改php.ini配置文件，禁用危险函数：
disable_funcions = dl,eval,exec,passthru,system,popen,shell_exec,proc_open,proc_terminate,curl_exec,curl_multi_exec,show_source,touch,escapeshellcmd,escapeshellarg
四.MySQL数据库账号安全：
禁止mysql用户外部链接，程序不要使用root账号，最好单独建立一个有限权限的账号专门用于Web程序。
五.查杀木马、后门
grep -r –include=*.php ‘[^a-z]eval($_POST’ . > grep.txt
grep -r –include=*.php ‘file_put_contents(.*$_POST\[.*\]);’ . > grep.txt
把搜索结果写入文件，下载下来慢慢分析，其他特征木马、后门类似。有必要的话可对全站所有文件来一次特征查找，上传图片肯定有也捆绑的，来次大清洗。
查找近2天被修改过的文件：
find -mtime -2 -type f -name \*.php
注意：攻击者可能会通过touch函数来修改文件时间属性来避过这种查找，所以touch必须禁止
六.及时给Linux系统和Web程序打补丁，堵上漏洞
3. unix.trojan.agent linux怎么清除木马
清除木马必须是需要杀毒软件 一般木马中毒都是通过下载软件，浏览未知网页Trojan一词的特洛伊木马本意是特洛伊的，指特洛伊木马，是木马计的故事木马会盗取你的账号，信息等资料如果电脑中了木马建议尽快杀毒以免造成系统问题可以先做一次全盘杀...
4. Linux centos 6.5 异常进程与木马查杀
都说Linux主机是非常安全的，但有时却不见得，第二次碰上Linux中木马了（我运气这么好？）。
废话不多说，直接进入主题。
一、状况描述：
1、2017.06.19早上过来发现ssh连接不上，以及各个官网都访问不了；
2、通过云主机厂商后台登录，发现nginx、tomcat、svn应用全部停止；
3、ping www.google.com (云主机在US) 不通；
二、问题定位：
应该是云主机被重启了，同时断开了外网（有些应用没有设置为自启动），于是重启公网的网卡后，ssh就可以登录了，手工启动了nginx、
omcat、svn等应用，因为上次也发生过几次这样的情况，据云厂商反馈，云主机对外发送大量的网络包，导致流量巨大，具体在Linux主机上的
体现就是cpu一直100%左右撑死，于是我怀疑是不是这次也是对外发送巨大的流量包，导致云主机厂商断了主机的外网呢？通过top命令查看
进程发现并没有cpu占用过高的进程，就ifconfig 查看了下网卡情况，显示网卡流量在2.4G左右（由于是事后了，没有截到先前的图），感觉很迅
速，于是我就又断开了一次，就没管了，到中午午休后，下午再次使用ifconfig，此时流量对外发送大量的流量包，累计流量竟然高达140G左右
（后面处理了，就累加了一点）：
这情况显示，肯定是中木马，由于Linux主机上面没有安装一些关于流量分析的软件，只从常用的top命令开始，发现并没有cpu占用很高的进程，
但发现有两个从来没见过的进程：MuYuHang 、LTF，通过 /proc/进程id 进入对应进程文件，ls -lh，发现可执行文件竟然指向了Tomcat bin目录
跟上次又是多么的相似，只是进程和文件名不一样罢了，于是简单的操作，kill -9 pid ，结果操作无效，很快进程起来，而且文件删除不了，报
operation not permitted（我可是用root用户执行的，难道还有root干不了的事情？具体了解可查看资料 lsattr和），删除后，过一会儿又自动恢
复。
三、ClamAV工具
关于ClamAV工具的用途以及安装，请网络搜索相关介绍和安装资料，大概说一下，ClamAV是Linux平台的一个木马扫描工具，可以扫描哪些
文件被感染了（但不能自动清除这些病毒，没有windows上面的杀毒软件那么强大），我安装在/home/clamav目录下。
四、解决办法
通过命令 /home/clamav/bin/clamscan -r --bell -i /，扫描这个根目录发现有不少的文件被感染了：
发现tomcat bin目录下的2个文件果然是被感染的了，同时发现有几个命令也被感染了如ps、netstat以及lsof，于是我清除了bsd-port这个目
录，同时把pythno清理，对于命令可以通过，从同版本的linux 没有问题的linux主机上面过来，删除后进行覆盖即可（也可以删除重装），
再把tomcat的文件删除，以及异常的进程kill掉，再用clamav扫描发现没有了，最后还需要检查下/etc/init.d这个开机启动的文件，检查里面自动启
动的，我这个里面就发现先前指向 /user/bin/bsd-port/knerl 这个，文件已经删除了，我同时把对应的sh，注释掉。目前来看，一切正常了。。。
五、总结
一次比较完整的定位问题，平时一般很少接触到查收木马的事情，碰上了就当学习，提升技能，只是不足，没有搞清木马是如何进来的，这
个需要后续不断的学习。心好累，Linux主机第二次中木马了。。。。