管理对象、存储方式、调用数据的方式、数据共享性、数据冗余度和数据不一致性、程序和数据的独立性、事务支持等区别。
1、管理对象：文件系统的管理对象是文件，而非直接对数据进行管理，不同的数据结构需要使用不同的文件类型进行保存。而数据库则直接对数据进行存储和管理。
2、存储方式：文件系统使用不同的文件将数据分类保存在外部存储上，如.doc、.mp4、.jpg等。而数据库系统使用标准统一的数据类型进行数据保存，如字母、数字、符号、时间等。
3、调用数据的方式：文件系统使用不同的软件打开不同类型的文件，如用Word打开.doc文件，用播放器打开.mp4文件。而数据库系统由数据库管理系统（DBMS）统一调用和管理数据。
4、数据共享性：文件系统实现以文件为单位的数据共享，而数据库系统实现以记录和字段为单位的数据共享，这使得数据库系统具有更高的数据共享性。
5、数据冗余度和数据不一致性：在文件系统中，数据冗余度大，容易造成数据的不一致。而在数据库系统中，数据是面向整个系统，数据可以被多个用户、多个应用共享使用，从而减少了数据冗余，也减少了数据不一致的可能性。
6、程序和数据的独立性：在文件系统中，程序和数据有一定的联系，当要修改数据的逻辑结构时，必须修改应用程序，修改文件结构的定义，数据和程序之间缺乏独立性。而在数据库系统中，通过DBMS的两级映象实现了数据的物理独立性和逻辑独立性，把数据的定义从程序中分离出去，减少了应用程序的维护和修改。
7、事务支持：数据库系统支持事务，即一系列对数据的操作集合要么都完成，要么都不完成。在DBMS上对数据的各种操作都是原子级的。