『壹』 强烈安利|27个非肿瘤综合性数据库推荐
在推荐数据库的领域中,对于非肿瘤方向的研究人员来说,选择合适的工具尤为重要。以下是我们精心挑选的几款综合性数据库,旨在覆盖多种研究领域,提供丰富资源。
数据库名称:RGD Disease数据库
网址:rgd.mcw.e/wg/portals/
功能:包括了多个疾病分支,如肿瘤、血液病、心血管、糖尿病、神经系统、免疫等。用户可以查询疾病的基因信息,涉及人类、大鼠、小鼠等物种,包括GO注释信息、基因注释信息(如疾病、物种保守性、作用的化合物、miRNA等)以及更多功能应用。
数据库名称:GEO数据库
网址:ncbi.nlm.nih.gov/geo
功能:由NCBI创建并维护,收录全球范围内的基因表达数据,包括微阵列芯片、二代测序等高通量数据。GEO分为GEO DataSets和GEO Profiles,前者存储数据集,后者关注基因表达谱。提供在线分析工具GEO2R,支持数据集和基因的差异分析。
数据库名称:ArrayExpress数据库
网址:ebi.ac.uk/arrayexpress/
功能:欧洲生物信息学研究所EBI旗下的数据库,专门用于保存微阵列基因表达数据,支持所有芯片和高通量测序数据的存储。用户可通过关键字搜索或高级过滤功能检索数据。
数据库名称:GeneCard数据库
网址:genecards.org/
功能:整合来自150个网络资源的基因信息,提供全面的人类基因注释,包括基因组、转录组、蛋白质组、遗传、临床和功能数据。是目前信息最为全面的基因注释网站之一。
数据库名称:OMIM数据库
网址:omim.org/
功能:关注人类基因变异与表型性状之间的关系,提供基因与表型关联的记录,包括突变位点、等位基因与表型的关联等信息。
数据库名称:ENCORI
网址:starbase.sysu.e.cn/
功能:主要服务于RNA相互作用研究,提供miRNA与其靶标mRNA/lncRNA/cirRNA/sncRNA之间的相互作用信息,以及RNA与RNA(lncRNA/cirRNA/sncRNA/miRNA)之间的证据来源,支持ceRNA机制、RBP与靶标相互作用等分析。
数据库名称:CellMarker
网址:biocc.hrbmu.e.cn/CellMarker
功能:收录了158种组织/亚组织的人细胞类型和81种组织/亚组织的小鼠细胞类型,提供细胞标志物的快速查找功能,支持物种搜索、高级筛选等操作。
数据库名称:CVDHD
网址:pkuxxj.pku.e.cn/CVDHD
功能:心血管系统数据库,包含常见心血管疾病的基因组、蛋白质组、转录组、遗传和功能信息,界面友好,提供疾病流行病学、临床特征和分子遗传学信息。
数据库名称:Drugbank数据库
网址:drugbank.ca/
功能:混合生物信息学与化学计量学资源,提供药物、靶点、转运蛋白及生物相互作用信息,支持药物用途、疾病、药效学和作用机制的检索。
数据库名称:AlzBase
网址:bigd.big.ac.cn/database
功能:专注于阿尔茨海默病(AD)相关基因信息,提供基因在不同数据集中的扰动频率、相关性、基因网络和综述等信息,支持AD研究。
数据库名称:qphos
网址:qptm.omicsbio.info/
功能:收集定量磷酸化数据,支持不同实验条件下或细胞类型中磷酸化位点的比较分析,为研究磷酸化相关分子机制提供帮助。
数据库名称:Gene to phenotype
网址:ebi.ac.uk/gene2phenotyp
功能:链接基因与临床表现,提供证据数据集的开发、验证、管理和分发,支持疾病实体与基因关联的检索。
数据库名称:shinyGEO
网址:gdancik.github.io/shinyGEO
功能:基于R语言的web应用,提供GEO数据库中数据集的下载和差异表达分析工具,支持高质量图片生成和代码输出。
数据库名称:Malacards
网址:malacards.org/
功能:整合72个数据库信息,提供疾病、基因突变、组织、相关疾病、论文发表情况、通路和症状等多维度信息检索。
数据库名称:SEdb
网址:licpathway.net/sedb/
功能:注释超级增强子在基因调控中的功能,提供遗传和表观遗传注释信息,包括SNP、序列变化、eQTL、风险SNP等数据。
数据库名称:gutMEGA
网址:gutmega.omicsbio.info
功能:肠道菌群数据库,支持不同条件(如疾病状态)下肠道菌群含量差异比较分析,提供可视化和自定义下载功能。
数据库名称:MENDA
网址:menda.cqmu.e.cn:8080/...
功能:整合抑郁症代谢特征数据,提供差异代谢物的筛选和分析,支持抑郁相关研究。
数据库名称:iUUCD
网址:iuucd.biocuckoo.org/ind...
功能:泛素和类泛素结合数据库,提供蛋白质相关信息,包括E1、E2、E3、DUB、UBD、ULD等。
数据库名称:ConsensusPathDB
网址:cpdb.molgen.mpg.de/
功能:分子功能互作数据库,整合蛋白互作、遗传互作、代谢组、基因调控和药物靶点互作信息。
数据库名称:SuperTarget
网址:insilico.charite.de/sup...
功能:收集药物-靶点关系信息,整合DrugBank、BindingDB和SuperCyp数据库,提供药物、蛋白质和副作用等实体信息。
数据库名称:CTD(比较毒物遗传数据库)
网址:ctdbase.org/
功能:促进环境暴露对人类健康影响的理解,提供化学-基因/蛋白质相互作用、化学-疾病和基因-疾病关系信息。
数据库名称:BioGPS
网址:biogps.org/#...
功能:便捷查询基因信息,展示基因简介、表达量、染色体定位、功能GO、转录本信息等,覆盖多物种。
数据库名称:EBI scSeq
网址:ebi.ac.uk/gxa/sc/home
功能:提供基因组、蛋白质、表达、小分子、蛋白质结构、系统、本体和文献等生物数据,支持遗传学对健康和多种疾病预防的探讨。
数据库名称:MIMIC 数据库
网址:about.citiprogram.org/e...
功能:重症医学数据库,为临床研究提供详细数据,包括随访资料,有助于探讨影响重症病人预后的因素。
数据库名称:BioLINCC
网址:biolincc.nhlbi.nih.gov/
功能:提供NHLBI临床注册研究和流行病学研究信息,包含研究总结、文献集合、生物标本和数据资源等。
数据库名称:PTMD
网址:ptmd.biocuckoo.org/
功能:搜集不同翻译后修饰(PTM)类型和疾病之间的关系,提供PTM事件和疾病分类信息,支持搜索和数据浏览。
数据库名称:Lncrnadisease
网址:cuilab.cn/lncrnadisease
功能:专注于lncRNA与疾病的关系,收录与166种疾病相关的1564个lncRNA数据,提供疾病和功能异常类型的标准化描述,支持新数据的关联预测。
以上数据库涵盖了生物信息学、病理学、药物研究、临床医学等多个领域,旨在为科研工作提供丰富的资源和工具,帮助研究人员深入探索非肿瘤方向的科学问题。
『贰』 ebsco最有名的两个数据库
ebsco最有名的两个数据库是Academic Search Complete和Business Source Complete。
1、Academic Search Complete是EBSCO公司旗下的一个文献数据库,涵盖了各个学科领域的期刊、图书、会议论文、研究报告、学位论文等,收录内容广泛,质量高。
该数据库拥有超过1.5亿篇文献,其中包括2.4万多种期刊和杂志,覆盖了多个学科领域,包括社会科学、人文科学、医学与生命科学、技术和工程等。
ebsco数据库的定位
EBSCO数据库是一个面向全球的综合性数据库服务提供商。其定位是为学术和商业界提供高质量的在线信息产品和服务,为用户提供更多的信息资源和研究工具,帮助用户在不同领域获取全面、及时、权威的信息。
EBSCO数据库公司成立于1944年,是一个独立公司,总部位于美国马萨诸塞州。公司的目标是为全球学术和商业界提供全面、及时、高质量的在线信息而致力于发展高质量的数字信息服务,包括定制的电子数据库、数字期刊、电子书等等,并且在全球范围内向学术和商业界用户提供信息服务。