肺癌大数据

⑴ 千讯基因大数据：肺癌为什么是中国发病率最高的癌症

• 一、肺癌发病率最高的是什么类型

• 二、肺癌的危害

• 三、怎样预防肺癌

• 肺癌发病率最高的是什么类型

1、肺癌发病率最高的是什么类型

肺癌发病率最高的是非小细胞肺癌类型,大约80%的肺癌患者得的是非小细胞肺癌。这种癌症的生长和扩散相比小细胞肺癌缓慢。非小细胞肺癌包括三种,鳞癌、腺癌和大细胞肺癌,它们的细胞类型不同。大多非小细胞肺癌的成因和吸烟有关,但少数腺癌和许多大细胞肺癌的病例成因还不明朗。

2、肺癌常见的诊断方法

2.1、放射性核素检查

可用于肺癌的诊断,显示癌病的范围,阳性率可达90%左右。

2.2、X线检查

这是最常用的诊断肺癌的方法。通过X线检查可以了解肺部癌变的部位和大小。早期肺癌可看到由于支气管阻塞引起的局部肺气肿、肺不张或病灶邻近部位的浸润性病变或肺部炎变。

2.3、细胞学检查

痰细胞学检查是一种简便有效的肺癌的诊断方法。中央型肺癌痰细胞学检查的阳性率可达70～90%,周围型肺癌痰检的阳性率则仅约50%左右,因此痰细胞学检查阴性者不能排除肺癌的可能性。

3、肺癌的常见治疗方法

3.1、外科疗法

手术疗法的目的是彻底切除肺部原发癌肿病灶和局部淋巴组织,并尽可能保留健康的肺组织。各型的肺癌,如病灶较小,原发肿瘤局限在支气管内,尚未发生远处转移,病人的全身情况较好,手术后五年生存率可达50%。

3.2、化学疗法

在各种类型的肺癌中,未分化小细胞癌对抗癌药物最为敏感,疗效最好,鳞状上皮细胞癌次之,腺癌敏感度最低。现时的化学治疗多数是用间歇性联合多种药物的方法,结合细胞动力学的原理,发挥药物间的协调作用,治疗的效果最好。

3.3、放射疗法

放射治疗是局部杀伤癌肿病灶的一种方法,在各型肺癌中,未分化小细胞癌对放射治疗最为敏感,次之为鳞状上皮细胞癌,腺癌的敏感度最低。多数肺癌病例在明确诊断时病变范围已较广泛,出现远行转移等不良情况,不适于施行手术治疗者应考虑放射治疗或抗癌药物治疗以改善症状和延长寿命。

• 肺癌的危害

1、癌肿可以导致支气管阻塞,原本正常肺泡囊腔消失,影响氧气与二氧化碳的交换,病人会因此感到胸闷、气短。

2、若肺癌占据肺部的大部分,会对患者的呼吸产生巨大影响。

3、支气管中的神经相当的敏感,癌症刺激到支气管,导致患者咳嗽。每个人都有这样的生活经验,支气管内掉进一颗饭粒,咳几声,将饭粒咳出来了,就不会再咳了。然而支气管内长出的癌块不会被咳出,这样就可发生一阵阵剧烈的干咳,不容易停止。甚至有时候出现咳血的现象,这是最典型的肺癌的危害。

4、由于癌症阻塞了支气管,导致支气管内分泌物即痰液无法排除,导致细菌滋生出现肺炎,出现发热,这种肺炎称阻塞性肺炎。

5、严重到一定程度可导致患者出现胸痛,也可能出现胸水。胸水多了压迫肺脏,增加了患者的呼吸难度,相当难治6、专家指出,如果肺癌得不到及时的控制,急速恶化下去,对患者的生命产生极大的威胁。

• 怎样预防肺癌

1、室内通风:有研究表明,中国女性肺癌与室内微小环境空气污染有关,因此预防肺癌要注意保持室内通风,改善室内空气质量。

2、建立良好饮食习惯:预防肺癌还要多摄入新鲜的蔬菜、水果,特别是含有类胡萝卜素的食品,可降低得肺癌的危险。

3、饮食预防与化学预防肺癌:肺癌的化学预防旨在通过使用药物、食物或营养成分来干预癌前病变,预防肺癌发生和分化逆转肿瘤细胞来达到预防和控制肺癌的目的。

4、戒烟:预防肺癌也与吸烟有关。开始吸烟的年龄、吸烟时间、每天吸烟支数、香烟种类都与肺癌有着密切的关系,吸烟者肺癌发病率是不吸烟者的10倍,而戒烟可明显降低肺癌发生率。

5、职业防护:职业环境中的呼吸道致癌物也是造成肺癌发病增多的重要原因,煤矿工、油漆工等一些特殊行业的职工应做好预防肺癌的措施。

6、减少厨房油烟:烹饪过程中产生的油烟是非吸烟肺癌的主要的病因之一,因此预防肺癌要尽量减少油炸、煎炒。

⑵ 肺癌研究进展 | Cell及其子刊上那些关于肺癌的多组学研究

肺 癌 是 全 球 发 病 率 和 致 死 率 最 高 的 恶 性 肿 瘤 ，据2018年全球肿瘤统计分析报告显示，全球肺癌的男女发病率分别为：年龄标化率（ASR）1.5/10万和14.6/10万；死亡率为ASR 27.1/10万和11.2/10万。

关于肺癌的多组学研究为科研人员和临床医生寻求更精确的诊断和治疗策略提供参考。7月9日出版的《 Cell 》连发三篇关于肺腺癌的蛋白组学+基因组的综合研究成果，之前 Cell 子刊《 Cell Metabolism 》也发表过关于小细胞肺癌的转录组+代谢组综合研究成果，这些多组学研究具有极为重要的临床指导意义。

研究人员利用蛋白质组学、磷酸蛋白质组学和基因组学数据对103例肺腺癌（LUAD）及其配对的非癌性邻近组织（NATs）进行了综合组学分析：

揭示了癌症相关的特征，例如肿瘤相关的蛋白质变体，独特的蛋白质组学特征以及早期患者或具有EGFR和TP53突变的患者的临床结局； 

基于蛋白质组的LUAD分层显示出与不同的临床和分子特征相关的三种亚型（S-I，S-II和S-III）； 

发现了潜在的药物靶标，并验证了HSP 90b的血浆蛋白水平是独立队列中LUAD的潜在预后生物标志。

原始蛋白质组学数据已上传至iProx，项目编号：IPX0001804000.

原始转录组数据已存入GEO，数据编号：GSE140343.

由于原始基因组数据的公开共享受到中国人遗条例限制，外显子组测序的详细结果见表S2。

研究人员对110个LUAD和101个NATs进行了全面的组学表征，包括基因组学，表观基因组学，深度蛋白质组学，磷酸蛋白质组学和乙酰蛋白质组学。

揭示了包括拷贝数、体细胞突变等基因层面改变的下游生物学功能；

通过磷酸化蛋白质组学方式鉴定出ALK-fusion作为诊断标记物和靶点的潜力；

鉴定得到了多个候选药物靶点：PTPN11(EGFR)、SOS1(KRAS)，中性粒细胞脱颗粒(STK11)；

LUAD肿瘤标记物蛋白磷酸化和乙酰化修饰也可能参与其中。

原始蛋白质组学数据可通过CPTAC数据门户网站获得：

👉 https://cptac-data-portal.georgetown.e/cptac/s/S056

基因组和转录组数据文件可在GDC获取：

👉 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001287.v5.p4.

研究人员在中国台湾收集了103名未经治疗的LUAD患者肿瘤组织和NATs，并进行了全外显子测序、RNA测序、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学检测。

首次展现了东亚人群中非吸烟LUAD患者的蛋白质基因组学景观，鉴定出23145个非同义体细胞单核苷酸变异（SNVs）。在转录组水平上，共量化了30155个RNA。在蛋白组水平上，超过10000个独特的蛋白质和20000个磷酸酶被量化；

突变特征分析揭示了年龄和性别相关的突变机制，高APOBEC突变特征存在于74%的年轻女性（≤60岁）和所有无EGFR突变的女性中，而男性患者中没有观察到类似的趋势；

通过蛋白质组特征对LUAD早期阶段进行临床分类；

找到了一个有潜力作为非小细胞肺癌早期检测和治疗的生物标志物MMP11。

蛋白质组学和磷蛋白组学分析的原始数据文件和处理后的数据已上传至NCI蛋白质组学数据共享平台：

👉 https://pdc.cancer.gov/pdc/study/PDC000219

👉 https://pdc.cancer.gov/pdc/study/PDC000220

研究人员运用代谢组和转录组等多组学研究手段，首先对小细胞肺癌细胞系，继而对基因工程小鼠和临床原发肿瘤组织等进行分析。

发现ASCL1低表达的小细胞肺癌细胞中嘌呤核苷酸的含量显著上升，同时伴随嘌呤合成通路中相关基因，特别是嘌呤合成途径中的关键限速酶—次黄嘌呤脱氢酶（IMPDH）的表达显著上调。代谢流分析结果显示，嘌呤合成途径的反应速率显著增加；

进一步的机制研究表明，ASCL1低表达的小细胞肺癌伴随了致癌基因MYC高表达，MYC作为转录因子通过激活IMPDH的转录从而促进了嘌呤合成速率；

在裸鼠移植瘤模型和肿瘤细胞中，抑制IMPDH能够降低ASCL1低表达的小细胞肺癌细胞和肿瘤组织的生长速度，提示IMPDH是一个潜在新型药物靶点。

研究相关资源和试剂的更多信息可向研究的主要联系人申请：[email protected].

国家基因库序列归档系统（CNSA） 可实现【基因组】和【代谢组】数据的一站式归档服务 （蛋白组数据归档功能正在开发中，敬请期待）。

👉 操作指引：登录CNGBdb → 导航栏点击 数据提交 →  进入CNSA：导航栏点击 提交入口 或 在页面点击 提交 按钮 → 数据提交页面可根据数据类型完成数据提交。

数据提交过程遇到任何问题都可直接联系[email protected]。

CNGBdb 的数据[存]储功能由旗下的国家基因库序列归档系统（CNSA，db.cngb.org/cnsa）负责，这是国内首个实现在线批量上传和审编的组学数据归档库，可支撑全球科研成果发表。截至2021年3月4日，CNSA已支持论文发表228篇，发表期刊127个，包括 The   Lancet、Nature、Science、Cell 等。 

首发公号：国家基因库大数据平台  

参考文献

[1] 周彩存, 王洁, 步宏, 等. 中国非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂治疗专家共识 (2019 年版)[J]. Chinese Journal of Lung Cancer, 2020, 23(2): 65.

[2] Xu J Y, Zhang C, Wang X, et al. Integrative proteomic characterization of human lung adenocarcinoma[J]. Cell, 2020, 182(1): 245-261. e17.

[3] Gillette M A, Satpathy S, Cao S, et al. Proteogenomic characterization reveals therapeutic vulnerabilities in lung adenocarcinoma[J]. Cell, 2020, 182(1): 200-225. e35.

[4] Chen Y J, Roumeliotis T I, Chang Y H, et al. Proteogenomics of Non-smoking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and Progression[J]. Cell, 2020, 182(1): 226-244. e17.

[5] Huang F, Ni M, Chalishazar MD, et al. Inosine Monophosphate Dehydrogenase Dependence in a Subset of Small Cell Lung Cancers. Cell Metab. 2018;28(3):369-382.e5. 

⑶ 有些人不抽烟，爱健身，为什么还会得肺癌

现在人生活的环境已经很糟糕，即使不吸烟不喝酒，还是会因为各种原因罹患癌症的。

我们人体是由许多细胞组成的，所有的器官，无论大小。如果人体细胞接触到紫外线灯、雾霾、乙肝病毒等有害物质，就会导致人体细胞基因突变。当然，并不是所有的基因突变都能导致癌症，事实上，只有关键基因，突变在正确的地方才能导致癌症。人体内有3万多个基因，只有少数与细胞分裂和增殖密切相关的基因才能致癌。

虽然不吸烟也能患癌症，但是显然吸烟罹患癌症的几率特别高。所以我们现在的环境影响，尽量远离有害物质。