❶ 如何在ubuntu上安裝lammps
編譯安裝 需要你有基本的linux操作基礎。要不就比較難搞了。
總的來講：
1.解壓 參考tar命令，或者右鍵選擇解壓。
2.編譯配置 ./configure 參考源代碼安裝說明。
3. 編譯 執行make命令 可以去了解一下gcc的用法。
4.安裝 執行make install命令
具體步驟：
以下需要root許可權。
-安裝fftw
1下載源碼包fftw-2.1.5.tar.gz，解壓 tar xvzf fftw-2.1.5.tar.gz
2 cd fftw-2.1.5.
3 ./configure --prefix=/opt/mathlib/fftw215-gnu --enable-float
其它選項:
4 make
5 make install
二安裝mpich
1下載mpich.tar.gz
2 cd mpich-1.2.7**
3 ./configure --prefix=/opt/mpich-gnu
4 make
5 make install
三編輯/etc/hosts.equiv文件，在其中加入本機主機名（用hostname可以得到），單獨一行！
前三步都在root下進行。
下面的步驟都在自己的用戶中進行
四安裝lammps
1 tar xvzf lammps.tar.gz
2 cd lammps**
3 cd src
4 vim MAKE/Makefile.g++
修改mpich的安裝路徑
修改fftw的安裝路徑
（每個都有兩處，include前面和lib前面的部分）
# g++ = RedHat Linux box, g++, MPICH2, FFTW
SHELL = /bin/sh
# System-specific settings
CC = g++
CCFLAGS = -g -O -DFFT_FFTW -DLAMMPS_GZIP -
DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK -I/opt/mathlib/fftw215-gnu/include -I/opt/mpich-
gnu/include
DEPFLAGS = -M
LINK = g++ -L/opt/mathlib/fftw215-gnu/lib -L/opt/mpich-
gnu/lib
LINKFLAGS = -g -O
USRLIB = -lfftw -lmpich
SYSLIB = -lpthread
ARCHIVE = ar
ARFLAGS = -rc
SIZE = size
# Link target
$(EXE): $(OBJ)
$(LINK) $(LINKFLAGS) $(OBJ) $(USRLIB) $(SYSLIB) -o $(EXE)
$(SIZE) $(EXE)
# Library target
lib: $(OBJ)
$(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(EXE) $(OBJ)
# Compilation rules
%.o:%.cpp
$(CC) $(CCFLAGS) -c $<
%.d:%.cpp
$(CC) $(CCFLAGS) $(DEPFLAGS) $< > $@
# Indivial dependencies
DEPENDS = $(OBJ:.o=.d)
include $(DEPENDS)
5 make g++ (在src目錄下)
生成lmp_g++
四運行lammps
1 cd ../bench
2 /opt/mpich-gnu/bin/mpirun -np 16 ../src/lmp_g++ <in.chain
❷ lammps package 安裝完lammps 裝可以嗎
在默認的情況下，lammps安裝了三個標准包， KSPACE, MANYBODY, MOLECULE.
並且可執行文件已經編譯好，生成了 lmp_linux可執行文件
在運行bench文件夾中的例子時，發現
lmp_linux < in.lj 可以正常運行
lmp_linux < in.chain 可以正常運行
lmp_linux < in.eam 可以正常運行
lmp_linux < in.rhodo 可以正常運行
lmp_linux < in.chute error，invalid pair style(force.cpp:168)