根據證書的不同，證書安裝路徑也會不同。主要和證書類型、證書作用和證書特殊指定有關。
（1）證書類型：Windows系統為不同種類的證書設置了一些專用路徑，分為系統證書（系統和C盤自帶的證書）、網頁證書（Internet Explorer等瀏覽器需要安裝的證書）和用戶證書（用戶自行安裝的證書），但是從Windows Server 2003起取消了這個分類方式。
（2）證書作用指定了這個證書只對該計算機上一些特定的軟體起作用，一般軟體會將這個證書安裝在軟體目錄下或者臨時文件夾。
（3）證書特定的路徑下也會安裝一些證書，比如一些網頁上面提供的證書會安裝在Internet Explorer文件夾以外的位置。
一般來說，現在的證書都會指定一個特定的路徑進行安裝，所以很難找到你需要的證書到底存放在哪裡。如果真的需要找到證書存放路徑，可以全盤搜索證書文件。證書文件的默認擴展名是crt、cer、key、der、pem，它們隨編輯和發布的平台不同而不同，之間存在差異。