高質量的資料庫有哪些

『壹』 ​強烈安利|27個非腫瘤綜合性資料庫推薦

在推薦資料庫的領域中，對於非腫瘤方向的研究人員來說，選擇合適的工具尤為重要。以下是我們精心挑選的幾款綜合性資料庫，旨在覆蓋多種研究領域，提供豐富資源。

資料庫名稱：RGD Disease資料庫

網址：rgd.mcw.e/wg/portals/

功能：包括了多個疾病分支，如腫瘤、血液病、心血管、糖尿病、神經系統、免疫等。用戶可以查詢疾病的基因信息，涉及人類、大鼠、小鼠等物種，包括GO注釋信息、基因注釋信息（如疾病、物種保守性、作用的化合物、miRNA等）以及更多功能應用。

資料庫名稱：GEO資料庫

網址：ncbi.nlm.nih.gov/geo

功能：由NCBI創建並維護，收錄全球范圍內的基因表達數據，包括微陣列晶元、二代測序等高通量數據。GEO分為GEO DataSets和GEO Profiles，前者存儲數據集，後者關注基因表達譜。提供在線分析工具GEO2R，支持數據集和基因的差異分析。

資料庫名稱：ArrayExpress資料庫

網址：ebi.ac.uk/arrayexpress/

功能：歐洲生物信息學研究所EBI旗下的資料庫，專門用於保存微陣列基因表達數據，支持所有晶元和高通量測序數據的存儲。用戶可通過關鍵字搜索或高級過濾功能檢索數據。

資料庫名稱：GeneCard資料庫

網址：genecards.org/

功能：整合來自150個網路資源的基因信息，提供全面的人類基因注釋，包括基因組、轉錄組、蛋白質組、遺傳、臨床和功能數據。是目前信息最為全面的基因注釋網站之一。

資料庫名稱：OMIM資料庫

網址：omim.org/

功能：關注人類基因變異與表型性狀之間的關系，提供基因與表型關聯的記錄，包括突變位點、等位基因與表型的關聯等信息。

資料庫名稱：ENCORI

網址：starbase.sysu.e.cn/

功能：主要服務於RNA相互作用研究，提供miRNA與其靶標mRNA/lncRNA/cirRNA/sncRNA之間的相互作用信息，以及RNA與RNA（lncRNA/cirRNA/sncRNA/miRNA）之間的證據來源，支持ceRNA機制、RBP與靶標相互作用等分析。

資料庫名稱：CellMarker

網址：biocc.hrbmu.e.cn/CellMarker

功能：收錄了158種組織/亞組織的人細胞類型和81種組織/亞組織的小鼠細胞類型，提供細胞標志物的快速查找功能，支持物種搜索、高級篩選等操作。

資料庫名稱：CVDHD

網址：pkuxxj.pku.e.cn/CVDHD

功能：心血管系統資料庫，包含常見心血管疾病的基因組、蛋白質組、轉錄組、遺傳和功能信息，界面友好，提供疾病流行病學、臨床特徵和分子遺傳學信息。

資料庫名稱：Drugbank資料庫

網址：drugbank.ca/

功能：混合生物信息學與化學計量學資源，提供葯物、靶點、轉運蛋白及生物相互作用信息，支持葯物用途、疾病、葯效學和作用機制的檢索。

資料庫名稱：AlzBase

網址：bigd.big.ac.cn/database

功能：專注於阿爾茨海默病（AD）相關基因信息，提供基因在不同數據集中的擾動頻率、相關性、基因網路和綜述等信息，支持AD研究。

資料庫名稱：qphos

網址：qptm.omicsbio.info/

功能：收集定量磷酸化數據，支持不同實驗條件下或細胞類型中磷酸化位點的比較分析，為研究磷酸化相關分子機制提供幫助。

資料庫名稱：Gene to phenotype

網址：ebi.ac.uk/gene2phenotyp

功能：鏈接基因與臨床表現，提供證據數據集的開發、驗證、管理和分發，支持疾病實體與基因關聯的檢索。

資料庫名稱：shinyGEO

網址：gdancik.github.io/shinyGEO

功能：基於R語言的web應用，提供GEO資料庫中數據集的下載和差異表達分析工具，支持高質量圖片生成和代碼輸出。

資料庫名稱：Malacards

網址：malacards.org/

功能：整合72個資料庫信息，提供疾病、基因突變、組織、相關疾病、論文發表情況、通路和症狀等多維度信息檢索。

資料庫名稱：SEdb

網址：licpathway.net/sedb/

功能：注釋超級增強子在基因調控中的功能，提供遺傳和表觀遺傳注釋信息，包括SNP、序列變化、eQTL、風險SNP等數據。

資料庫名稱：gutMEGA

網址：gutmega.omicsbio.info

功能：腸道菌群資料庫，支持不同條件（如疾病狀態）下腸道菌群含量差異比較分析，提供可視化和自定義下載功能。

資料庫名稱：MENDA

網址：menda.cqmu.e.cn:8080/...

功能：整合抑鬱症代謝特徵數據，提供差異代謝物的篩選和分析，支持抑鬱相關研究。

資料庫名稱：iUUCD

網址：iuucd.biocuckoo.org/ind...

功能：泛素和類泛素結合資料庫，提供蛋白質相關信息，包括E1、E2、E3、DUB、UBD、ULD等。

資料庫名稱：ConsensusPathDB

網址：cpdb.molgen.mpg.de/

功能：分子功能互作資料庫，整合蛋白互作、遺傳互作、代謝組、基因調控和葯物靶點互作信息。

資料庫名稱：SuperTarget

網址：insilico.charite.de/sup...

功能：收集葯物-靶點關系信息，整合DrugBank、BindingDB和SuperCyp資料庫，提供葯物、蛋白質和副作用等實體信息。

資料庫名稱：CTD（比較毒物遺傳資料庫）

網址：ctdbase.org/

功能：促進環境暴露對人類健康影響的理解，提供化學-基因/蛋白質相互作用、化學-疾病和基因-疾病關系信息。

資料庫名稱：BioGPS

網址：biogps.org/#...

功能：便捷查詢基因信息，展示基因簡介、表達量、染色體定位、功能GO、轉錄本信息等，覆蓋多物種。

資料庫名稱：EBI scSeq

網址：ebi.ac.uk/gxa/sc/home

功能：提供基因組、蛋白質、表達、小分子、蛋白質結構、系統、本體和文獻等生物數據，支持遺傳學對健康和多種疾病預防的探討。

資料庫名稱：MIMIC 資料庫

網址：about.citiprogram.org/e...

功能：重症醫學資料庫，為臨床研究提供詳細數據，包括隨訪資料，有助於探討影響重症病人預後的因素。

資料庫名稱：BioLINCC

網址：biolincc.nhlbi.nih.gov/

功能：提供NHLBI臨床注冊研究和流行病學研究信息，包含研究總結、文獻集合、生物標本和數據資源等。

資料庫名稱：PTMD

網址：ptmd.biocuckoo.org/

功能：搜集不同翻譯後修飾（PTM）類型和疾病之間的關系，提供PTM事件和疾病分類信息，支持搜索和數據瀏覽。

資料庫名稱：Lncrnadisease

網址：cuilab.cn/lncrnadisease

功能：專注於lncRNA與疾病的關系，收錄與166種疾病相關的1564個lncRNA數據，提供疾病和功能異常類型的標准化描述，支持新數據的關聯預測。

以上資料庫涵蓋了生物信息學、病理學、葯物研究、臨床醫學等多個領域，旨在為科研工作提供豐富的資源和工具，幫助研究人員深入探索非腫瘤方向的科學問題。

『貳』 ebsco最有名的兩個資料庫

ebsco最有名的兩個資料庫是Academic Search Complete和Business Source Complete。

1、Academic Search Complete是EBSCO公司旗下的一個文獻資料庫，涵蓋了各個學科領域的期刊、圖書、會議論文、研究報告、學位論文等，收錄內容廣泛，質量高。

該資料庫擁有超過1.5億篇文獻，其中包括2.4萬多種期刊和雜志，覆蓋了多個學科領域，包括社會科學、人文科學、醫學與生命科學、技術和工程等。

ebsco資料庫的定位

EBSCO資料庫是一個面向全球的綜合性資料庫服務提供商。其定位是為學術和商業界提供高質量的在線信息產品和服務，為用戶提供更多的信息資源和研究工具，幫助用戶在不同領域獲取全面、及時、權威的信息。

EBSCO資料庫公司成立於1944年，是一個獨立公司，總部位於美國馬薩諸塞州。公司的目標是為全球學術和商業界提供全面、及時、高質量的在線信息而致力於發展高質量的數字信息服務，包括定製的電子資料庫、數字期刊、電子書等等，並且在全球范圍內向學術和商業界用戶提供信息服務。