從原則上來說，對同一資料庫類型來說，高版本的資料庫的jar應該是可以正常訪問低版本的資料庫的。所以沒有必要因為這個而分成兩個工程。你只要在工作中使用高版本的jar就可以了。
如果你的兩個資料庫是不同類型的話，那麼資料庫訪問的jar也就不一樣，使用的類也不會相同。
那也就沒有必要分成兩個工程。
如果確實需要分成兩個工程的話，那可以考慮用一個工程將結果輸出到文件中，另外一個工程將結果從文件中讀取。當然，因為文件的打開關閉操作會比較慢，所以可能需要設置一個固定的時間點進行一次寫入之後再關閉文件。
另外你說的servlet是什麼意思?是你的兩個工程其實都是web工程嗎?
如果是web工程的話，那其實兩個工程確實可以無縫操作。因為對web工程來說，所有訪問都是提交一個url，並將參數一起提交。
像你這種情況，你可以在A工程的action中將結果取得之後post到B工程的插入資料庫操作的action中去，然後在那個action中進行資料庫的插入操作。
2. Linux C 怎麼實現兩個線程同步讀取兩個內存的數據
在Linux系統中使用C/C++進行多線程編程時，我們遇到最多的就是對同一變數的多線程讀寫問題，大多情況下遇到這類問題都是通過鎖機制來處理，但這對程序的性能帶來了很大的影響，當然對於那些系統原生支持原子操作的數據類型來說，我們可以使用原子操作來處理，這能對程序的性能會得到一定的提高。那麼對於那些系統不支持原子操作的自定義數據類型，在不使用鎖的情況下如何做到線程安全呢？本文將從線程局部存儲方面，簡單講解處理這一類線程安全問題的方法。
一、數據類型
在C/C++程序中常存在全局變數、函數內定義的靜態變數以及局部變數，對於局部變數來說，其不存在線程安全問題，因此不在本文討論的范圍之內。全局變數和函數內定義的靜態變數，是同一進程中各個線程都可以訪問的共享變數，因此它們存在多線程讀寫問題。在一個線程中修改了變數中的內容，其他線程都能感知並且能讀取已更改過的內容，這對數據交換來說是非常快捷的，但是由於多線程的存在，對於同一個變數可能存在兩個或兩個以上的線程同時修改變數所在的內存內容，同時又存在多個線程在變數在修改的時去讀取該內存值，如果沒有使用相應的同步機制來保護該內存的話，那麼所讀取到的數據將是不可預知的，甚至可能導致程序崩潰。
如果需要在一個線程內部的各個函數調用都能訪問、但其它線程不能訪問的變數，這就需要新的機制來實現，我們稱之為Static memory local to a thread (線程局部靜態變數)，同時也可稱之為線程特有數據（TSD: Thread-Specific Data）或者線程局部存儲（TLS: Thread-Local Storage）。這一類型的數據，在程序中每個線程都會分別維護一份變數的副本()，並且長期存在於該線程中，對此類變數的操作不影響其他線程。如下圖：
二、一次性初始化
在講解線程特有數據之前，先讓我們來了解一下一次性初始化。多線程程序有時有這樣的需求：不管創建多少個線程，有些數據的初始化只能發生一次。列如：在C++程序中某個類在整個進程的生命周期內只能存在一個實例對象，在多線程的情況下，為了能讓該對象能夠安全的初始化，一次性初始化機制就顯得尤為重要了。——在設計模式中這種實現常常被稱之為單例模式（Singleton）。Linux中提供了如下函數來實現一次性初始化：
#include <pthread.h>
// Returns 0 on success, or a positive error number on error
int pthread_once (pthread_once_t *once_control, void (*init) (void));
利用參數once_control的狀態，函數pthread_once()可以確保無論有多少個線程調用多少次該函數，也只會執行一次由init所指向的由調用者定義的函數。init所指向的函數沒有任何參數，形式如下：
void init (void)
{
// some variables initializtion in here
}
另外，參數once_control必須是pthread_once_t類型變數的指針，指向初始化為PTHRAD_ONCE_INIT的靜態變數。在C++0x以後提供了類似功能的函數std::call_once ()，用法與該函數類似。使用實例請參考https://github.com/ApusApp/Swift/blob/master/swift/base/singleton.hpp實現。