A. 如何用NCBI資料庫查病毒全基因的背景信息
選擇NCBI genome資料庫，這個庫中收錄目前經過測序的所有物種的參考基因組。你只要輸入你需要的病毒名稱比如HIV，就可以看到這個病毒的全基因組序列。你還可以點擊某條序列，進入到詳細信息界面，就可以看到這個序列的來源。
B. 怎麼用NCBI查詢FeSOD基因的蛋白質序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
直接把這個基因進行查詢，在不同的模塊下就有不同的信息：比如在Gene資料庫就會顯示geneID，染色體位置信息等。在Nucleotido中就可查到對應的核苷酸序列。其實你任意點進去一個，在仔細找裡面的鏈接也OK。
C. 請教：怎麼用NCBI查詢新城疫病毒F基因的蛋白質序列、氨基酸序列和核苷酸序列呢
NCBI主頁，選gene/protein database，查newcastle F,選擇該基因直接連接到其基因網頁：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=912271&ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum
核苷酸序列：這個基因網頁上，有一項Genomic regions, transcripts, and procts。單擊那個NC_002617.1（這個是此gene所在的染色體區域），會有兩個nucleotide選項，選擇FASTA，就連接到NCBI sequence viewer，顯示整個gene的序列。
氨基酸序列：還是這個基因網頁，底部有一個NP_071469.1， 點擊進去連接到蛋白質網頁，最下面就是氨基酸序列
蛋白質序列和氨基酸序列是一樣的吧
D. 在NCBI中如何查詢基因的功能
知道了名字，在搜索框里輸入後可以看到相應的搜索結果，然後點擊進去，有個「MIM」（在線孟德爾遺傳）就可以看到它的功能。
ORF是開放閱讀框，指的是mRNA上編碼氨基酸的那段序列，從AUG開始，直到終止子，但是不包括終止子。ORF的數據在進入NCBI主頁的右下側一個叫ORFfinder的超鏈接里，點擊進去後輸入相應序列的mRNA序列，然後再點擊ORF find就可以預測處它的ORF，但是往往會有很多結果，一般來說第一個結果是真實的，其餘的都是假陽性的。
fasta格式指的就是一個大於號開頭，後面跟上這段序列的描述，然後另起一行就是數列，給你個例子你就知道了，如下，這就是人類USF1 mRNA的fasta格式
>gi|46877100|ref|NM_007122.3| Homo sapiens upstream transcription factor 1 (USF1), transcript variant 1, mRNA
AAAAAAAAAAA
這就是fasta格式，你可以以TXT的方式保存，也可以以後綴名為.fasta的方式保存，然後以文本文件打開就行了，說白了就是個文本文件呵呵。一般情況下這樣就可以了，但是如果用blast2go來做GO分類的話，就必須用.fasta來保存，否則該軟體不識別。詳細的在NCBI上都有的，自己可以去看。