❶ 怎麼在uniprot中查找非經典分泌
NCBI NCBI下有很多資料庫，以下是蛋白質序列PopSet 包括研究1個人群、1個種系產生或描寫人群變化的1組組聯合序列。PopSet既包括核酸序列數據又包括蛋白質序列數據。 Entrez 功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈接，既可在同1資料庫內鏈接，也可在資料庫之間進行鏈接。當應用BLAST軟體比較某氨基酸或DNA序列與庫中其他氨基酸或DNA序列差異即進行類似性檢索時，則會觸及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈接。庫間鏈接產生在核苷酸資料庫內的記錄與PubMed庫中已發表序列的引文間的鏈接，或蛋白質序列記錄與核苷酸序列庫中編碼它的核苷酸序列間的鏈接。BLAST(Basic Local Alignment Search Tool）是用於序列類似性檢索的1個重要資料庫，是辨別基因和基因特點的工具。該軟體能在15秒內完成全部DNA資料庫的序列檢索。BLAST記錄的相干度有明確的統計學解釋，以便更容易地將相干記錄與隨機的資料庫記錄像辨別。在NCBI主頁的左工具條中，點擊BLAST圖標，即進入BLAST主頁。 BLAST 主頁提供了幾種BLAST檢索軟體。其中BLAST2.0是1種新的BLAST檢索工具，它在原有基礎上作了改進，運行速度更快，靈敏度更高，同時具有Gapped BLAST 和PSI-BLAST兩種軟體的新功能。Gapped BLAST 允許在對準的序列中引入空位（鹼基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味著在比較兩個相干序列時不會出現中斷（Break）現象。這些空位對準的記分系統更能反應相干序列的類似程度。PSI-BLAST的全稱是Position-Specific Iterated BALST，即特殊位置重復BLAST，它提供了自動、易用的概貌（Profile）檢索，是查找序列同源的有效工具。Dnastar 可以用於解決你踢完的後半個問題
❷ PDB資料庫怎麼下載蛋白質的二級結構序列
蛋白質資料庫是指包括蛋白質信息的資料庫。常用的蛋白質資料庫有很多，其中Uniprot被認為收錄最廣泛和注釋信息最全面的蛋白質資料庫。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD，詳見Uniprot_網路。其他的蛋白資料庫有PDB（Protein Data Bank，簡稱PDB，開始建立於1971年）等。國內也有些如由上海生物信息技術研究中心下屬的生物信息科學數據共享平台建立及維護的SDSPB等。
❸ uniprot蛋白質序列資料庫由哪幾部分組成各有什麼特點
將PIR、SWISS-PROT和TrEMBL3個蛋白質資料庫統一-起來組建而成，包含3個部分:
(1) UniProt Knowledgebase (UniProtKB) ，這是蛋白回質序列、功能答、分類、交叉引用等蛋白質知識庫，記錄經過人工篩選和注釋;
■ (2) UniRef ( UniProt Non-rendant Reference )
資料庫，將密切相關的蛋白質序列組合到一條記錄中，以便提高搜索速度;目前，根據序列相似程度形成3個子庫，即UniRef100、UniRef90和UniRef50;
■ (3) UniParc (UniProt Archive)，是UniProt存檔庫 ,
收錄所有蛋白質序列。用戶可以通過文本查詢資料庫，可以利用BLAST程序搜索資料庫，也可以直接通過FTP下載數據。
❹ uniprot資料庫怎麼打不開
估計被牆了 別人在境外的告訴我可以登
❺ uniprot 數據 是否有統計 信息
NCBI NCBI下有很多資料庫，以下是蛋白質序列PopSet 包括研究1個人群、1個種系產生或描寫人群變化的1組組聯合序列。PopSet既包括核酸序列數據又包括蛋白質序列數據。 Entrez 功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈接，既可在同1資料庫內鏈接，也可在資料庫之間進行鏈接。當應用BLAST軟體比較某氨基酸或DNA序列與庫中其他氨基酸或DNA序列差異即進行類似性檢索時，則會觸及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈接。
❻ 1. 簡述SRS資料庫檢索系統主要特點,與UniProt資料庫有哪些異同
同學啊！！自己總結吧！！哈哈~~~總結好了群里共享啊 ~~~
❼ 如何在uniprot資料庫中查找某個蛋白序列
NCBI
NCBI下有很多資料庫，以下是蛋白質序列PopSet
包括研究1個人群、1個種系產生或描寫人群變化的1組組聯合序列。PopSet既包括核酸序列數據又包括蛋白質序列數據。
Entrez
功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈接，既可在同1資料庫內鏈接，也可在資料庫之間進行鏈接。當應用BLAST軟體比較某氨基酸或DNA序列與庫中其他氨基酸或DNA序列差異即進行類似性檢索時，則會觸及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈接。庫間鏈接產生在核苷酸資料庫內的記錄與PubMed庫中已發表序列的引文間的鏈接，或蛋白質序列記錄與核苷酸序列庫中編碼它的核苷酸序列間的鏈接。BLAST(Basic
Local
Alignment
Search
Tool）是用於序列類似性檢索的1個重要資料庫，是辨別基因和基因特點的工具。該軟體能在15秒內完成全部DNA資料庫的序列檢索。BLAST記錄的相干度有明確的統計學解釋，以便更容易地將相干記錄與隨機的資料庫記錄像辨別。在NCBI主頁的左工具條中，點擊BLAST圖標，即進入BLAST主頁。
BLAST
主頁提供了幾種BLAST檢索軟體。其中BLAST2.0是1種新的BLAST檢索工具，它在原有基礎上作了改進，運行速度更快，靈敏度更高，同時具有Gapped
BLAST
和PSI-BLAST兩種軟體的新功能。Gapped
BLAST
允許在對準的序列中引入空位（鹼基缺失或插入），引入空位（Gaps）意味著在比較兩個相干序列時不會出現中斷（Break）現象。這些空位對準的記分系統更能反應相干序列的類似程度。PSI-BLAST的全稱是Position-Specific
Iterated
BALST，即特殊位置重復BLAST，它提供了自動、易用的概貌（Profile）檢索，是查找序列同源的有效工具。Dnastar
可以用於解決你踢完的後半個問題
❽ 為什麼在uniprot中一個ID會對應到PDB資料庫中的多個ID
連接字元串?不同資料庫不一樣,這個不需要看懂,拷貝過來改一下就可以了。